В 1794 году Екатериной II был подписан Указ об устройстве Екатерино-Лебяжской пустыни.
6 августа 2014 года состоялось празднование 220-й годовщины со дня основания мужского монастыря в посёлке Лебяжий Остров.
По приглашению епископа Ейского и Тимашевского Германа Божественную литургию возглавил Митрополит Екатеринодарский и Кубанский Исидор. Ему сослужили управляющий Ейской епархией Преосвященнейший епископ Ейский и Тимашевский Герман и управляющий Армавирской епархией Преосвященнейший епископ Армавирский и Лабинский Игнатий.
В праздничной службе принимали участие референт митрополита Екатеринодарского и Кубанского Исидора архимандрит Трифон (Плотников), благочинный Приморско-Ахтарского церковного округа протоиерей Иоанн Феер, секретарь епархиального управления протоиерей Евгений Хаджипараш, настоятель Свято-Никольского храма г. Краснодара протоиерей Василий Плиска, наместник Свято-Екатерининской Николаевской Лебяжьей пустыни игумен Григорий (Хоркин), настоятель Свято-Екатерининского Кафедрального собора г. Краснодара протоиерей Игорь Олжабаев, благочинный Каневского церковного округа протоиерей Владислав Кашков, благочинный Калининского церковного округа протоиерей Константин Кливекин, благочинный Староминского церковного округа протоиерей Алексей Самойленко, настоятель храма Богоявления Господня игумен Юрий (Пальчиков), секретарь епархиального управления протоиерей Александр Ковалев, благочинный церквей Ейского округа протоиерей Роман Дейнега, благочинный Кущевского церковного округа протоиерей Георгий Брусник, благочинный Брюховецкого церковного округа протоиерей Родион Драпов, насельник пустыни иеромонах Митрофон (Охалов),благочинный церквей Уманского округа протоиерей Георгий Меденцев, насельники Свято-Духова мужского монастыря иеромонах Никон (Примаков) и иеромонах Василий (Тельнов), ключарь Кафедрального собора Святитель Николай г.Ейска иерей Дмитрий Самохин, штатные клирики Кафедрального собора г. Краснодара протодиакон Сергий Мрачко и диакон Андрей Небавский, штатный клирик Кафедрального собора Святителя Николая Мир Ликийских Чудотворца диакон Петр Акинфин.
Также на Богослужение прибыли многие клирики Ейской епархии. Проповедь перед причастием сказал игумен Юрий (Пальчиков).
После Литургии к присутствующим обратились православные иерархи Кубанской митрополии.
Митрополит Исидор, обращаясь к высоким гостям, казачеству, паломникам, прибывшим на праздничную службу, отметил, что «Люди съезжаются сюда по зову сердца, и неслучайно сказано: к сухому колодцу не идут. Это место священно, здесь наши корни, наша история. А, значит, никогда не угаснет наша вера». Также митрополит Исидор выразил благодарность епископу Ейскому и Тимашевскому Герману за то, что именно его трудами Лебяжья пустынь приобрела статус монастыря.
Преосвященнейший епископ Ейский и Тимашевский Герман, поздравляя земляков с возрождением Лебяжьей обители, отметил, что по молению Божьему началось восстановление храма, и он будет возрожден! Вновь и вновь зазвонят колокола, возвысится общая молитва. Владыка выразил надежду, что монастырь непременно станет местом духовного просвещения не только кубанцев. Промыслом Божиим, общими молитвами и трудами современников возможно создать на этом священном месте первую Кубанскую казачью Лавру.
В приветственном слове Преосвященнейший епископ Армавирский и Лабинский Игнатий поблагодарил епископа Ейского и Тимашевского Германа за приглашение на праздничную Божественную литургию, пожелал братии крепкой молитвы и чтобы Господь собрал в этом месте всех тех, кто возродит Лебяжью пустынь.
С поздравлениями на праздничные мероприятия прибыли заместитель вице-губернатор Кубани Галина Дмитриевна Золина и главы муниципальных образований 10-ти районов, входящих в состав Ейской епархии.
Галина Дмитриевна зачитала поздравительное обращение губернатора Краснодарского края А.Н. Ткачёва, а затем обратилась ко всем присутствующим с теплыми словами:
– Слава Богу, что стал возможен этот праздник, свидетелями которого мы являемся. Каждый из нас молил Господа о том, чтобы он состоялся. Низкий вам поклон от губернатора Кубани, огромная вам благодарность.
Почетной грамотой администрации края за активное участие в духовно-нравственном развитии Кубани был награждён Правящий Архиерей Преосвященнейший Герман, епископ Ейского и Тимашевский. Также Почетная грамота администрации края была вручена настоятелю Екатерино-Лебяжского мужского монастыря отцу Григорию.
Особо значимым событием в день рождения обители стало возвращение домой трех старейших храмовых икон.
После торжественной церемонии гости монастыря посетили музей, посвященный истории обители, выставочную экспозицию «Возрождение. Лебяжий остров – культурно-историческое наследие», а так же артезианский колодец – водонапорную башню, которую также планируется восстановить.